Projekt Genome of Europe (GoE) je mezinárodní projekt řešený v období říjen 2024 až březen 2028. Cílem projektu je vytvoření referenční genomické databáze s 100 000 osekvenovanými genomy (v pozdějších letech dokonce až s půl milionem genomů), která bude reprezentativní pro evropskou populaci. Česká republika je v projektu zastoupena Masarykovou univerzitou, která přispěje genomickými daty 3 000 jedinců. Výsledná databáze bude využitelná pro výzkum a aplikace v oblasti precizní medicíny.

Financováno programem Evropské unie Digitální Evropa (grantová dohoda č. 101168231) a dále Ministerstvem školství, mládeže a tělovýchovy ČR (projekt č. 9H24001).

Co a proč přesně v projektu děláme?

Cílem projektu je vytvořit kontrolní databázi genetické informace (získanou metodou celogenomového sekvenování, WGS) pro zdravou populaci z různých zemí Evropy. Tato databáze následně pomůže lépe rozlišit genetické varianty, které jsou neškodné (a typické pro danou zemi či populaci), od variant, které mohou hrát roli v rozvoji různých onemocnění. Čeští vědci a lékaři navíc díky projektu získají přístup k nejmodernějším poznatkům a mohou se o ně podělit s evropskými kolegy.

Co přesně projekt přinese, si můžeme vysvětlit na příběhu: Paní Eva má vzácné zdravotní obtíže, které by mohly mít genetickou příčinu. Lékaři u ní najdou tisíce drobných odchylek oproti referenčnímu genomu. Bez pořádné databáze je těžké rozhodnout, které varianty jsou neškodné (vyskytují se běžně v české populaci) a které rizikové. Díky GoE a mezinárodní výměně informací by mohli lékaři rychle vyfiltrovat „typicky české“ odchylky a zacílit jen na ty, které jsou skutečně problematické. Paní Eva se tak vyhne dalším dlouhým vyšetřením a nejistotě – diagnóza a případná léčba budou přesnější a rychlejší.

Jak se mohou zapojit dobrovolníci, kteří chtějí poskytnout do databáze svůj genom?

V současné době probíhají jednání s etickými komisemi a právními odděleními Masarykovy univerzity a spolupracujících institucí, skrze které bude možné se do projektu zapojit. Do té doby se můžete přihlásit do databáze dobrovolníků. Jakmile to bude aktuální, ozveme se vám na e-mail, který do databáze vložíte, a pozveme vás k účasti na projektu.

Jak funguje evropské sdílení dat?

Projekt Genome of Europe klade maximální důraz na ochranu soukromí, bezpečnost dat a důsledné dodržování etických i legislativních norem. Abychom co nejlépe vysvětlili, jak a proč se data sdílejí, představme si každou zemi jako knihovnu a genom každého člověka jako knihu:

  • Každá země (knihovna) má své knihy (genomy)
  • Knihy zůstávají trvale v domovské knihovněnikdy se fyzicky neposílají do zahraničí.
  • Výzkumníci, kteří chtějí pracovat s daty, musejí mít speciální schválený přístup („knihovnickou kartičku“) a přísně dodržovat nastavená pravidla ochrany dat.
  • Knihy se nepůjčují domů. Ani výzkumníci, ani jiné organizace si knihu nemohou odnést či zkopírovat.
  • Fyzicky zůstává kniha (genom) vždy ve své zemi.
  • Pokud chce kdokoli cokoli v knihách hledat, není to jen tak. Výzkumník přichází za „knihovníkem“ (specializovaným systémem) a řekne například: „Potřebuji zjistit, v kolika knihách (genomech) se na straně 50 (v určité genové oblasti) vyskytuje slovo 'kočka' (konkrétní genetická varianta).“
  • Knihovník provede vyhledání ve všech knihách ze všech knihoven a vyexportuje pouze statistiky (kolik knih obsahovalo zmíněnou variantu).
  • Knihovník nikdy nevydá celý text knihy (celý genom) a neukáže ani konkrétní stránky (citlivé osobní údaje). Výstupem jsou pouze souhrnné výsledky.
  • Tento model zajišťuje, že lidské genomy (knihy) zůstanou pod ochranou v domovské zemi a nikdy nejsou přímo vystaveny vnějšímu riziku. Výsledkem je efektivní a bezpečné sdílení informací mezi vědci z různých států.

Kdo za projektem stojí?

  • Na evropské úrovni je projekt koordinován týmem z ​nizozemské instituce Erasmus MC (André Uitterlinden, Helen Ray-Jones, Jeroen van Rooij a další).​
  • V České republice má projekt na starost tým z CEITECu Masarykovy univerzity koordinovaný prof. Šárkou Pospíšilovou.

Přehled zapojených institucí a osob, jež koordinují příslušné řešitelské týmy:

Belgie KU Leuven Prof. dr. Joris Vermeesch
  Sciensano Dr. Wannes van Hoof
  VIB Dr. Frederik Coppens
Bulharsko MUS Prof. dr. Radka Kaneva
Česká republika MU Prof. dr. Šárka Pospíšilová
Dánsko NGC Dr. Ivana Bogicevic
Estonsko UTARTU Prof. dr. Andres Metspalu
Finsko UH Prof. dr. Markus Perola
Francie CEA Dr. Jean-François Deleuze
  INSERM Dr. Emmanuelle Genin
Chorvatsko RBI Prof. dr. Oliver Vugrek
Irsko RCSI Prof. dr. Gianpiero Cavalleri
Itálie CCM Dr. Gualtiero Colombo
  CNR Prof. dr. Graziano Pesole
  FHT Prof. dr. Nicole Soranzo
Kypr UCY Prof. dr. Constantinos Deltas
Litva VULSK Prof. dr. Laima Ambrozaityte
Lotyšsko LBMC Prof. dr. Janis Klovins
Lucembursko LIH Dr. Frank Glod
  LNDS Dr. Davit Chokoshvili
Malta MFH Dr. Miriam Dalmas
Německo EKUT Prof. dr. Olaf Rieß
  ELIXIR Dr. Serena Scollen
  HMGU Prof. dr. Eleftheria Zeggini
Nizozemí Erasmus MC Prof. dr. André Uitterlinden
  LP Dr. Jasper Bovenberg
Norsko UIO Prof. dr. Trine Rounge
Polsko IBCH Prof. dr. Luiza Handschuh
  UNILODZ Dr. Blazej Marciniak
Portugalsko BioData.pt Prof. dr. Ana Teresa Freitas
  INSA Prof. dr. Astrid Vicente
Rakousko CEMM Prof. dr. Cristoph Bock
  MUG Prof. dr. Ellen Heitzer
  MUI Prof. dr. Johannes Zschocke
  MUW Prof. dr. Markus Hengstschläger
Rumunsko GRDI Dr. Octavian Bucur
Řecko BRFAA Prof. dr. Dimitris Thanos
  UPAT Prof. dr. George Patrinos
Slovinsko UKCL Dr. Jernej Kovač
  UL Dr. Damjana Rozman
Španělsko CNAG Dr. Ivo Gut
  ISCIII Dr. Beatriz Pérez
  F.S.P. CNIO Dr. Anna González-Neira
  UPV/EHU Dr. Maria Pilar Nicolas
Švédsko UU Dr. Adam Ameur

 Poslední aktualizace: 15. dubna 2025

 

Bez popisku
Bez popisku

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info