Projekt Genome of Europe (GoE) je mezinárodní projekt řešený v období říjen 2024 až březen 2028. Cílem projektu je vytvoření referenční genomické databáze s 100 000 osekvenovanými genomy (v pozdějších letech dokonce až s půl milionem genomů), která bude reprezentativní pro evropskou populaci. Česká republika je v projektu zastoupena Masarykovou univerzitou, která přispěje genomickými daty 3 000 jedinců. Výsledná databáze bude využitelná pro výzkum a aplikace v oblasti precizní medicíny.
Financováno programem Evropské unie Digitální Evropa (grantová dohoda č. 101168231) a dále Ministerstvem školství, mládeže a tělovýchovy ČR (projekt č. 9H24001).
Co a proč přesně v projektu děláme?
Cílem projektu je vytvořit kontrolní databázi genetické informace (získanou metodou celogenomového sekvenování, WGS) pro zdravou populaci z různých zemí Evropy. Tato databáze následně pomůže lépe rozlišit genetické varianty, které jsou neškodné (a typické pro danou zemi či populaci), od variant, které mohou hrát roli v rozvoji různých onemocnění. Čeští vědci a lékaři navíc díky projektu získají přístup k nejmodernějším poznatkům a mohou se o ně podělit s evropskými kolegy.
Co přesně projekt přinese, si můžeme vysvětlit na příběhu: Paní Eva má vzácné zdravotní obtíže, které by mohly mít genetickou příčinu. Lékaři u ní najdou tisíce drobných odchylek oproti referenčnímu genomu. Bez pořádné databáze je těžké rozhodnout, které varianty jsou neškodné (vyskytují se běžně v české populaci) a které rizikové. Díky GoE a mezinárodní výměně informací by mohli lékaři rychle vyfiltrovat „typicky české“ odchylky a zacílit jen na ty, které jsou skutečně problematické. Paní Eva se tak vyhne dalším dlouhým vyšetřením a nejistotě – diagnóza a případná léčba budou přesnější a rychlejší.
Jak se mohou zapojit dobrovolníci, kteří chtějí poskytnout do databáze svůj genom?
V současné době probíhají jednání s etickými komisemi a právními odděleními Masarykovy univerzity a spolupracujících institucí, skrze které bude možné se do projektu zapojit. Do té doby se můžete přihlásit do databáze dobrovolníků. Jakmile to bude aktuální, ozveme se vám na e-mail, který do databáze vložíte, a pozveme vás k účasti na projektu.
Jak funguje evropské sdílení dat?
Projekt Genome of Europe klade maximální důraz na ochranu soukromí, bezpečnost dat a důsledné dodržování etických i legislativních norem. Abychom co nejlépe vysvětlili, jak a proč se data sdílejí, představme si každou zemi jako knihovnu a genom každého člověka jako knihu:
- Každá země (knihovna) má své knihy (genomy)
- Knihy zůstávají trvale v domovské knihovně a nikdy se fyzicky neposílají do zahraničí.
- Výzkumníci, kteří chtějí pracovat s daty, musejí mít speciální schválený přístup („knihovnickou kartičku“) a přísně dodržovat nastavená pravidla ochrany dat.
- Knihy se nepůjčují domů. Ani výzkumníci, ani jiné organizace si knihu nemohou odnést či zkopírovat.
- Fyzicky zůstává kniha (genom) vždy ve své zemi.
- Pokud chce kdokoli cokoli v knihách hledat, není to jen tak. Výzkumník přichází za „knihovníkem“ (specializovaným systémem) a řekne například: „Potřebuji zjistit, v kolika knihách (genomech) se na straně 50 (v určité genové oblasti) vyskytuje slovo 'kočka' (konkrétní genetická varianta).“
- Knihovník provede vyhledání ve všech knihách ze všech knihoven a vyexportuje pouze statistiky (kolik knih obsahovalo zmíněnou variantu).
- Knihovník nikdy nevydá celý text knihy (celý genom) a neukáže ani konkrétní stránky (citlivé osobní údaje). Výstupem jsou pouze souhrnné výsledky.
- Tento model zajišťuje, že lidské genomy (knihy) zůstanou pod ochranou v domovské zemi a nikdy nejsou přímo vystaveny vnějšímu riziku. Výsledkem je efektivní a bezpečné sdílení informací mezi vědci z různých států.
Kdo za projektem stojí?
- Na evropské úrovni je projekt koordinován týmem z nizozemské instituce Erasmus MC (André Uitterlinden, Helen Ray-Jones, Jeroen van Rooij a další).
- V České republice má projekt na starost tým z CEITECu Masarykovy univerzity koordinovaný prof. Šárkou Pospíšilovou.
Přehled zapojených institucí a osob, jež koordinují příslušné řešitelské týmy:
Belgie |
KU Leuven |
Prof. dr. Joris Vermeesch |
|
Sciensano |
Dr. Wannes van Hoof |
|
VIB |
Dr. Frederik Coppens |
Bulharsko |
MUS |
Prof. dr. Radka Kaneva |
Česká republika |
MU |
Prof. dr. Šárka Pospíšilová |
Dánsko |
NGC |
Dr. Ivana Bogicevic |
Estonsko |
UTARTU |
Prof. dr. Andres Metspalu |
Finsko |
UH |
Prof. dr. Markus Perola |
Francie |
CEA |
Dr. Jean-François Deleuze |
|
INSERM |
Dr. Emmanuelle Genin |
Chorvatsko |
RBI |
Prof. dr. Oliver Vugrek |
Irsko |
RCSI |
Prof. dr. Gianpiero Cavalleri |
Itálie |
CCM |
Dr. Gualtiero Colombo |
|
CNR |
Prof. dr. Graziano Pesole |
|
FHT |
Prof. dr. Nicole Soranzo |
Kypr |
UCY |
Prof. dr. Constantinos Deltas |
Litva |
VULSK |
Prof. dr. Laima Ambrozaityte |
Lotyšsko |
LBMC |
Prof. dr. Janis Klovins |
Lucembursko |
LIH |
Dr. Frank Glod |
|
LNDS |
Dr. Davit Chokoshvili |
Malta |
MFH |
Dr. Miriam Dalmas |
Německo |
EKUT |
Prof. dr. Olaf Rieß |
|
ELIXIR |
Dr. Serena Scollen |
|
HMGU |
Prof. dr. Eleftheria Zeggini |
Nizozemí |
Erasmus MC |
Prof. dr. André Uitterlinden |
|
LP |
Dr. Jasper Bovenberg |
Norsko |
UIO |
Prof. dr. Trine Rounge |
Polsko |
IBCH |
Prof. dr. Luiza Handschuh |
|
UNILODZ |
Dr. Blazej Marciniak |
Portugalsko |
BioData.pt |
Prof. dr. Ana Teresa Freitas |
|
INSA |
Prof. dr. Astrid Vicente |
Rakousko |
CEMM |
Prof. dr. Cristoph Bock |
|
MUG |
Prof. dr. Ellen Heitzer |
|
MUI |
Prof. dr. Johannes Zschocke |
|
MUW |
Prof. dr. Markus Hengstschläger |
Rumunsko |
GRDI |
Dr. Octavian Bucur |
Řecko |
BRFAA |
Prof. dr. Dimitris Thanos |
|
UPAT |
Prof. dr. George Patrinos |
Slovinsko |
UKCL |
Dr. Jernej Kovač |
|
UL |
Dr. Damjana Rozman |
Španělsko |
CNAG |
Dr. Ivo Gut |
|
ISCIII |
Dr. Beatriz Pérez |
|
F.S.P. CNIO |
Dr. Anna González-Neira |
|
UPV/EHU |
Dr. Maria Pilar Nicolas |
Švédsko |
UU |
Dr. Adam Ameur |
Poslední aktualizace: 15. dubna 2025
|